草豆蔻种子含黄酮类化合物：槲皮素(quprcetin)，山柰酚(kaempferol)，鼠李柠檬素(rhamnocitrin)，熊竹素(kumatakenin)，山姜素(alpinetin)，小豆蔻查耳酮(cardamonin) ，生松黄烷酮(pinocembrin)；二苯基庚烷类化合物：（5R）-反-1，7-二苯基-5-羟基-Δ6-庚-烯-3-酮[(5R)-trans-1,7-diphenyl-5-hy-droxy-6-hepten-3-one]，（3S，5S）-反-1，7-二苯基-3，5-二羟基-Δ1-庚烯[(3S,5S)-trans-1,7-diphenyl-3,5-dihydroxy-1-heptene]，反-1，7-二苯基-5-羟基-Δ1-庚烯(trans-1,7-diphenyl-5-hydroxy-1-heptene)，反，反-1，7-二苯基-5-羟基-Δ4，6-庚二烯-3-酮(trans,trans-1,7-diphenyl-5-hydroxy-4,6-heptadien-3-one)，(3S,5R)-3,5-二羟基-1，7-二苯基庚烷[(3S,5R)-3，5-dihydroxylheptane]，反，反-1，7-二苯基-Δ4，6-庚二烯-3-酮(trans,trans-1,7-diphenyl-4,6-heptadien-3-one)。肿子的挥发油中含有反-桂皮醛(trans-cinnamaldehyde)，反，反-金合欢醇(trans,trans-farnesol)，桉叶素(1,8-cineole)，α-律草烯(α-humulene)，芳樟醇(linalool)，樟脑(camphor)，4-松油醇(terpineol-4)，莳萝艾菊酮(carvotanacetone)，乙酰龙脑酯(bornyl acetate)乙酸牻牛儿酯(geranyl acetate)，桂皮酸甲酯(methyl cinnamate)，橙花叔醇(netolidol)，樟烯(camphorene)，柠檬烯(limonene)，α-蒎烯(α-pinene),β-蒎烯(β-pinene)，龙脑(borneol)。还含有微量元素(μg/g)：铜(Cu) 6.94，铁(Fe)54.7，锰(Mn)144。

根茎中含有二氢-5，6-去氢卡瓦胡椒素(dihydro-5,6-dehydrokawain)和5，6-去氢卡瓦胡椒素(5,6-dehydrokawain)。