该品适用于治疗大肠杆菌、变形杆菌属（吲哚阳性与吲哚阴性）、产气杆菌、肺炎杆菌、粘质沙雷菌、不动杆菌属和葡萄球菌属所致严重感染。如败血症、细菌性心内膜炎、尿路生殖系统感染、呼吸道感染、胆道感染、骨骼皮肤感染、软组织感染（包括烧伤）、腹腔感染、急慢性中耳炎、鼻窦炎等。由于其毒性较大，卡那霉素B不宜用于长程治疗（如结核病）。卡那霉素B对绿脓杆菌无效。
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