在正常的生长时期，真菌的菌丝一般是疏松的，但在繁殖期或不良环境条件下，菌丝相互紧密的交织在一起，形成各种形态的菌丝组织体，常见的有根状菌索和菌核，某些高等真菌在繁殖时期产生孢子的结构，习称子实体，容纳果的褥座称子座。子座是真菌从营养阶段到繁殖阶段的一种过渡形式。
真菌的分类和主要药用种类：冬虫夏草：带子座的菌核（僵虫）即名贵药材冬虫夏草。
猪苓：菌核入药有利尿渗湿之效，猪苓多糖有抗癌作用。
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