化合物不易结晶，其原因一种是本身的性质所决定，另一种在很大程度上是由于纯度不够，夹杂不纯物引起的。若是后者就需要进一步分离纯化，若是本身的性质，往往需要制备结晶性的衍生物或盐，然后用化学方法处理，回复到原来的化合物，达到分离纯化的目的。
如生物碱，常通过成盐来达到纯化，常用的有盐酸盐，氢溴酸盐、氢碘酸盐、过氯酸盐和苦味酸盐等。如粉末状莲心碱是通过过氯酸盐结晶而纯化的；治疗肝炎药物的有效成分垂盆草苷，本身是不结晶的，其乙酰化物却具有良好的针状晶体。此外，也可利用某些化合物与某种溶剂形成复合物或加成物而结晶，如穿心莲亚硫酸氢钠加成物在稀丙酮中容易结晶；蝙蝠葛碱能和氯仿或乙醚形成加成物结晶医学教育|网搜集整理。但有些结晶性化合物在用不同溶剂结晶时亦可形成溶剂加成物，如汉防己乙素能和丙酮形成结晶的加成物；千金藤素能与苯形成加成物结晶。
结晶的形状很多，常见为针状、柱状、棱柱状、板状、方晶、粒状、簇状及多边形棱柱状晶体等，结晶形状随结晶的条件不同而异。
