完整的黏膜上皮是阻止异物、微生物进入深层组织的天然生理屏障。此外，口腔黏膜上皮内还存在一种上皮内屏障。主要由上皮细胞成熟过程中所排出进入细胞外间隙的膜被颗粒组成。在角化的口腔上皮，膜被颗粒与细胞膜连接，伸长形成一系列平行的板层结构。在非角化的口腔上皮，膜被颗粒以一种密集非层状中心轴的形式循环排列。所有膜被颗粒都与细胞膜融合医学教|育网搜集整理，排出它们的内容物进入细胞外间隙。它主要包含中性脂及一些极性脂，而不是磷脂，膜被颗粒缺乏磷脂层，说明它参与了非角化区上皮间隙屏障的形成。
此外，前述基底膜复合物，又构成了有选择通透性的大分子物质滤过性屏障。
