治疗程序一般分4个阶段。
（1）第一阶段：基础治疗。
本阶段的目的在于运用牙周病常规的治疗方法消除致病因素，控制牙龈炎症。此阶段亦称病因治疗。包括以下几个方面：
1）教育并指导患者自我控制菌斑的方法，如建立正确的刷牙方法和习惯，使用牙线、牙签、间隙刷等辅助工具保持口腔卫生等。
2）施行洁治术、根面平整术以消除龈上和龈下的菌斑、牙石。
3）消除菌斑滞留因素及其他局部刺激因素，如充填龋洞、改正不良修复体、治疗食物嵌塞
等，还应做必要的牙髓治疗、纠正口呼吸习惯等。
4）拔除无保留价值的或预后极差的患牙，对不利于将来修复治疗的患牙也应在适当时机拔除。
5）在炎症控制后进行必要的咬合调整，使建立平衡的咬合关系，必要时可做暂时性的松牙固定。有些牙周炎患牙在炎症消除后，牙齿位置能有轻度的自行调整，故调治疗应在炎症消退后进行。
6）药物治疗：在经上述治疗特别是消除菌斑、牙石等局部刺激物后，如果病情仍不能控制或有明显的急性炎症以及对某些重症患者，可辅以药物治疗，还可服用补肾固齿的中成药或汤剂等。也可在刮治后作袋内冲洗并置入抗菌药物，并给以漱口剂。临床研究显示，龈下刮治加局部使用抗菌药物可在一定程度上提高疗效、减少复发。
7）发现和尽可能纠正全身性或环境因素，如吸烟、用药情况、全身病的控制等。
在第一阶段治疗结束后的6～8周，应复诊再评估前一阶段疗效，一是看下一步还需哪种治疗，二是观察患者对?析反应，三是了解依从性，同时还应进一步了解患者全身情况，如对糖尿病等疾病的控制效果，吸烟者是否已戒烟，自我控制菌斑情况如何等。据此决定下一阶段治疗计划。
（2）第二阶段：牙周手术治疗。
一般在基础治疗后的再评估中对牙周情况（包括袋深度、牙石菌斑控制情况、牙槽骨形态、牙松动度等）进行全面评价。此时如果仍有5mm以上的牙周袋，且探诊仍有出血，或牙龈及骨形态不良、膜龈关系不正常时，则一般均医学教育网须进行手术治疗。其目的是为了能在直视下进行彻底的根面平整和清除感染组织，而且可以纠正牙龈及骨的外形，植入自体骨或骨替代材料以及生物膜以期获得牙周组织的再生。手术主要包括下列内容：
1）翻瓣术：是最常用、最基本的牙周手术，将袋内壁切除并翻开黏骨膜瓣，在直视下进行根面及软组织清创，然后将瓣复位缝合，以使牙周袋变浅或消除。在翻瓣术的同时还可进行牙槽骨成形或植骨，以恢复牙周组织的生理形态和功能。
2）植骨术：在根分叉病变或垂直型骨吸收处，通过移植自体骨、异体骨或骨替代品达到牙槽骨病损的修复。
3）引导性组织再生术（GTR）：是通过手术使原已暴露在牙周袋中的病变牙根面上形成新附着，即牙周组织的再生，形成新的牙骨质、牙槽骨和牙周膜。若能同时进行植骨术，其疗效更优于单独引导性组织再生或植骨术。，
4）膜龈手术：是用以改正附着龈过窄、牙龈退缩及唇、颊系带附着位置不佳等的手术，以巩固牙周治疗效果和解决美观问题。
5）种植术：用外科手段将人工牙根植入牙槽骨内，以支持其上部结构的义齿修复体。临床研究表明，种植术对于缺牙患者，尤其是无牙颌者能够解决总义齿固位不良，而且达到理想地恢复功能、语言和美观。但种植术必须在全口牙周炎症得到控制的条件下施行。
（3）第三阶段：修复治疗阶段。
修复治疗虽不属于牙周病学的内容，但它是牙周炎治疗程序中重要的组成部分，特别是永久性的修复治疗，以及在修复缺牙的同时固定余留的松动牙。一般在牙周手术后2～3个月开医.教育网搜集始进行。此时牙龈的外形和龈缘位置已基本稳定，可进行永久性固定修复或可摘式义齿修复，必要时可同时固定松动牙。对于牙排列不齐或错者，也可进行正畸治疗，以建立稳定的平衡。
（4）第四阶段：牙周支持治疗。
也称维护期，这是正规的牙周系统性治疗计划中不可缺少的部分，它是牙周疗效得以长期保持的先决条件。在第一阶段治疗结束后，无论是否需要手术和修复治疗，维护期即应开始，其内容包括以下方面：
1）定期复查：根据患者剩余牙的病情以及菌斑控制的好坏，确定复查的间隔期。治疗刚结束时，复查应稍密集些，如1～2个月，以了解疗效保持情况。若病情稳定后，可酌情延长间隔期。复查时间应根据每位患者的情况而确定。一般每3～6个月复查一次，约1年拍X线片，监测和比较牙槽骨的变化。
2）复查内容：检查患者菌斑控制情况及软垢、牙石量，牙龈炎症（探诊后有无出血）及牙周袋深度、附着水平，牙槽骨高度、密度及形态，咬合情况及功能、牙松动度，危险因素（如吸烟、全身疾病）的控制情况等。
3）复治：根据复查发现的问题制订治疗计划并进行治疗，并针对患者在执行口腔卫生措施中存在的问题给以指导。
以上四个阶段的治疗计划视每位患者的具体情况而定，第一和第四两个阶段的内容对每位患者都是必须的，而第二和第三阶段的内容则酌情安排。
总的治疗计划制定后，可能会有1～2个可供患者选择和考虑的方案，应向患者解释治疗计划的目的、意义及所做治疗的内容，经医患共同讨论确定一个治疗计划。总之，牙周炎治疗的成功与否，一方面在于有周密正确的治疗计划和医生精湛、细致的治疗技术，另一方面要求患者的认真配合和持之以恒的自我控制茵斑，两者缺一不可，否则任何治疗均不能维持长久的疗效。
