氢氧化钙仍有其局限性，作为盖髓剂的局限性有：
①强碱性造成与之接触组织发生变性和坏死，具有较强的组织和细胞毒性；
②还需增加一些防腐抗菌、促进黏性、便于操作的药物成分配制成氡氧化钙制剂，通常是在制剂中加入碘仿后配制成氢氧化钙碘仿制剂；
③不阻射X线，常需增加一些X线阻射药物，便于治疗检查；
④盖髓后短期效果较好，长期则可能引起牙髓退变，以及引起修复性医学教育|网搜集整理牙本质的持续沉积，严重者使根管变窄或堵塞，从而给活髓保存治疗失败病例的继续治疗造成障碍。
为此，人们为了中止氢氧化钙制剂治疗后所发生的持续钙化过程，尤其对于需利用根管进行牙体修复的病例，在牙根发育完成之后，需及时去除全部牙髓并进行根管充填，因而，外伤的年轻恒牙，活髓切断术常常只作为过渡性的治疗。
