黏膜病变一般为亚急性或慢性炎症。念珠菌侵入组织，引起上皮表层水肿，角化层内有中性粒细胞浸润，常形成微小脓肿。上皮棘层增生，上皮钉突呈圆形，基底膜部分被炎症破坏。在角化层或上皮的外1／3处可见菌丝，菌丝与上皮表面多呈垂直型或旱一定角度，HE染色不甚清晰，PAS染色为强阳性。结缔组织中有充血的毛细血管及大量淋巴细胞、浆细胞和中性粒细胞浸润。
急性假膜性念珠菌病的白色斑膜；镜下见上皮变性坏死，并有大量念珠状菌的菌丝及孢子。孢子的直径约4μm，有清楚的荚膜，革兰染色为阳性。真菌和孢子含有大量多糖类医`学教育网搜集整理。PAS染色为强阳性，呈玫瑰红色。孢子聚集成团，菌丝为细长杆形，呈串珠状或分节状。
病变处可作涂片检查，方法为轻轻刮白色斑膜的表层，放置于清洁的载玻片上，滴加10%～15%氢氧化钾（或氢氟化钠）溶液，再加盖玻片，放于光学显微镜下观察菌丝及孢子。也可将涂片进行PAS染色，观察其菌丝及孢子。
肉芽肿性念珠菌病，为发生于黏膜的特异性肉芽肿性反应，主要在黏膜固有层形成含有巨细胞的肉芽肿，病变多见于舌、口唇及软腭黏膜，PAS染色在巨细胞的胞浆内可见吞噬的芽孢，呈阳性反应。
