影响中药药理作用的因素有诸多方面。主要有三大因素：药物因素、机体因素、环境因素。
药物的品种与产地、炮制、剂型、配伍等因素均影响中药药理作用。
配伍和禁忌：
中药配伍是中医用药的主要形式，即按病情的需要和药物性能，选择两种以上药物配合应用，以达到增强药物的疗效，调节药物的偏胜，减低毒性或副作用。中药配伍的基本内容是“七情”，即：单行、相须、相使、相畏、相杀、相恶、相反。具体而言，配伍中的相须，即两种功用相似的药物配合应用，可相互增加疗效。如黄连与连翘同用对金黄色葡萄球菌的抑菌力比单用黄连强6倍以上。相使，即两种功用不同的药相伍，能互相促进提高疗效。如补气的黄芪与祛湿的茯苓合用，能相互增强补气利水的功能。相畏，是一种药物制约另一种药的性能或抑制另一种药物的毒性或烈性。如截疟七宝散中的常山通过槟榔的相畏，抑制了常山致恶心、呕吐等消化道反应，但不影响其抗疟作用。相杀，即一种药物能够减轻或消除另一药物的毒性。如绿豆能杀巴豆毒。相恶，就是一种药物的功效能被[医.学敎育.网搜.集整理]另一种药物削弱或破坏，或两者的功效均降低或丧失，如黄芩能减低生姜的温性。在白虎加人参汤中，知母、人参都有降血糖作用，但两药合用却使降血糖作用减弱甚至消失。相反，即两种药物合用后，可产生毒性反应或副作用。实验证明，甘草与芫花合用LD50,减小，毒性增大。因此，相须、相使配伍，在药效上发挥了增效协同作用，相畏、相杀配伍能减低或消除毒性，以上均为用药之所求；相恶配伍在药效上产生拮抗作用，相反配伍则出现较多的不良反应或增强毒性，这两种配伍为用药之所忌。为了用药安全，避免毒性副作用的发生，七情中的相反、相恶是复方配伍禁忌中应当遵循的原则。
用药安全还必须注意妊娠禁忌。根据药物对孕妇和胎儿危害程度不同，可分为禁用和慎用两类。禁用药大多是毒性较大或药性峻烈的药物，例如水蛭、虻虫、三棱、莪术等。慎用药大多是破气、行滞、通经、活血以及辛热、滑利、沉降的药物，如桃仁、大黄、附子、肉桂等。近代实验报道，半夏对妊娠过程是有一定影响的。如半夏汤灌胃给药可使妊娠大鼠阴道出血率、胚胎死亡率比正常的显著增高。注射给药对小鼠胚胎有致畸作用。说明半夏动胎之说有其道理。又如芫花中的芫花萜、芫花素可引起多种怀孕动物发生流产，可能是该药可引[医.学敎育.网搜.集整理]起子宫内膜炎症，使溶酶体破坏，促进前列腺素合成释放增加，使子宫平滑肌收缩。莪术中的萜类和倍半萜类化合物，牡丹皮的有效成分牡丹酚对鼠均有抗早孕作用。水蛭、冰片、麝香酮等对小鼠有一定终止妊娠的作用。
