山茱萸不同组分对免疫系统影响不同，水煎液可降低网状内皮系统的吞噬功能，抑制SRBC或DNCB（2，4-二硝基氯苯）所致迟发型超敏反应，抑制T淋巴细胞的活化。山茱萸总苷和熊果酸能明显抑制T淋巴细胞增殖、转化，抑制LAK细胞（淋巴因子激活的杀伤细胞）生成和白细胞介素-2的产生，对器官移植产生的排斥反应有明显的对抗作用，每日腹腔注射山茱萸总苷500mg/kg，连续给药6天，可明显延长小鼠移植心脏后的存活时间。而水煎液对体液免疫有促进作用，可加速血清抗体IgG、IgM形成。
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