1.液-液萃取法是利用混合物中各成分在两种互不相溶的溶剂中分配系数的不同而达到的分离方法。如以正丁醇水萃取法使皂苷（如人参皂苷等）转移至正丁醇层与水溶性杂质分开。萃取时，各成分在两相溶剂中分配系数差异越大，则分离效果越好。
2.沉淀法是根据物质溶解度差异进行分离的方法。
（1）溶剂沉淀法：利用溶液中加入另一种溶剂使极性改变，某些成分溶解度改变而析出沉淀。
如：水／醇法：药材水提取浓缩液加入数倍量乙醇，水溶性大分子（多糖、蛋白质等）被沉淀；醇／水法：药材醇提取浓缩液加入数倍量水，静置，沉淀除去树脂，叶绿素等脂溶性杂质；醇／醚（丙酮）法：药材醇提取浓缩液加入数倍量醚（丙酮），可使皂苷析出，脂溶性杂质等留在母液中。
（2）酸碱沉淀法：某些酸、碱或两性化合物可采用加入酸、碱调节溶液的pH值，分子的状态（游离型或解离型）变化，使其溶解度改变。如提取黄酮、蒽醌、酚酸性成分，可采用碱提取酸沉淀。如一些生物碱的提取可以采用酸提取碱沉淀法。
（3）盐析法：酸性或碱性化合物还可加入某种试剂使之生成水不溶性的盐类等沉淀析出，与其他水溶性较大的杂质分离。如酸性化合物可制成铅盐等。根据具体的化合物也可采用其他试剂，如自三颗针中提取小檗碱就是加入氯化钠促使盐酸小檗碱析出沉淀的。
