桂林医学院药学院前身为桂林医专药学系，创办于1976年，为广西最早开办西药教育的院系。1987年开始招收本科生，2002年更名为桂林医学院药学院。

药学院拥有6670平方米的药学实验教学楼，仪器设备共计约一千万元，其中万元以上仪器设备81台；在全国建立了30多家稳定的社会实践教学基地。目前开设药学、药物制剂、市场营销（医药方向）三个本科专业及药学（临床药学）、药学（社会药房）两个方向，药学、医药市场营销两个高职专业，在校生1900多名。

桂林医学院药学院是全国高等医学教育研究会常务理事单位，全国普通高等专科药学类规划教材建设委员会会员单位，广西执业药师继续教育培训基地。学院拥有一支结构合理、素质较高的教师队伍。现有教职工86人，其中教授15人、副教授及相当职称22人；博士学位23人，硕士学位31人，在职攻读博士学位4人。师资学历、学缘、专业结构趋于合理。

药学学科获一级学科硕士授予权建设学科；药学专业为国家级特色专业建设点；药学实验教学中心为省级实验教学示范中心；药理学、生药学、药剂学获广西高校重点学科；《生药学》、《药理学》、《分析化学》为省级精品课程；中药药理实验室为“国家中药药理三级实验室”医学教育网编辑整|理，生药学实验室为“广西高校重点实验室”。近三年来，药学院共获省级以上教改课题12项，获省级教学成果一等奖1项、三等奖1项，主编或参编各类教材30余部；承担省部级以上科研课题46项，经费900余万。

药学院在重视多学科融合基础性研究的同时，依托桂林医学院药物研究所，加强“产学研”合作，组建了“广西特色药用资源开发和利用研究校企共建实验室”、“桂林中小企业生物医药制剂开发中试平台”和“桂林罗汉果产业技术创新战略联盟”等研发平台，以广西稀缺药用资源及其开发应用作为重点研究方向。

长期以来，药学院以社会人才需求为导向，重视学生实践能力、自主学习能力培养，积极组织学生参与国家及省级各类技能竞赛，均取得优异成绩；通过加强校企联合办学、建立“实习—就业相结合”模式、“筑巢引凤”模式，努力培养立足广西、面向全国的“零适应期”应用型药学人才，近年学生就业率保持在96%以上。在历代桂医药学人的努力下，桂医药学院已建设成为在区内外有明显教学特色，产、学、研紧密结合的多层次药学人才培养基地。