医疗机构制剂需要遵循的质量标准主要包括《中华人民共和国药典》、《医疗机构制剂配制质量管理规范》（GPP）等。其中，《中华人民共和国药典》是国家制定的药品质量标准，所有在中国境内生产、销售和使用的药品都必须符合其规定。而《医疗机构制剂配制质量管理规范》则详细规定了医疗机构在进行制剂配制时应达到的质量管理要求，包括人员、厂房与设施、设备、物料、文件管理、生产过程控制、质量控制等方面的内容，确保所配制的制剂能够安全有效。
此外，各地方卫生行政部门还可能根据实际情况制定一些补充性或更具体的规定，医疗机构在进行制剂配制时也应予以遵守。总之，所有这些标准和规范的目的都是为了保证医疗机构制剂的质量，保障患者用药的安全性和有效性。
