蛋白质的二级结构主要指的是肽链主链原子局部的空间排布,不涉及侧链的构象。蛋白质的二级结构主要有以下几种形式:
1. α-螺旋(Alpha Helix):α-螺旋是蛋白质中最常见的二级结构之一,是由多肽链沿着中心轴缠绕形成的右手螺旋结构。每个氨基酸残基沿螺旋上升约0.15nm,每隔3.6个氨基酸残基螺旋上升一圈。
2. β-折叠(Beta Sheet):β-折叠是一种伸展的肽链结构,相邻的肽键平面以锯齿状排列形成片层结构。这些片层可以是平行的也可以是反平行的,取决于相邻多肽链的方向是否相同或相反。
3. β-转角(Beta Turn):β-转角也称为发夹结构,它是连接两个二级结构元件之间的短片段,通常由4个氨基酸组成,能够使肽链方向发生180度转折。
4. 无规卷曲(Random Coil):除了上述明确的二级结构外,蛋白质中还存在一些区域无法归类为α-螺旋或β-折叠等规则结构,这些区域称为无规卷曲。但实际上,“无规”并不意味着完全没有规律,而是在特定条件下可能表现出一定的局部有序性。
以上就是蛋白质二级结构的主要形式。