常用的抗疟药有氯喹、青蒿素类药物（如青蒿琥酯、双氢青蒿素）、奎宁、甲氟喹和阿托伐醌等。这些药物分别适用于不同类型的疟疾：
1. 氯喹：对间日疟原虫和卵形疟原虫引起的疟疾有很好的治疗效果，但对恶性疟原虫（特别是耐药性恶性疟）的效果较差。
2. 青蒿素类药物：主要用于治疗由恶性疟原虫引发的重症疟疾，对于其他类型的疟疾也有一定的疗效。青蒿琥酯和双氢青蒿素是常用的两种制剂形式。
3. 奎宁：与氯喹类似，对间日疟、卵形疟等非恶性疟有较好的效果，但因其副作用较大，通常作为二线用药。
4. 甲氟喹：可以用于治疗各种类型的疟疾，尤其是对于耐药性较强的恶性疟原虫感染更为有效。
5. 阿托伐醌：常与其他药物联合使用来预防或治疗疟疾，特别是对于前往高风险地区旅行的人群来说是一个不错的选择。
在实际应用中，医生会根据患者的具体情况（如感染的疟原虫种类、是否为耐药株等）以及药物的安全性和有效性综合考虑选择合适的抗疟药物。
