基因工程在制药中的应用非常广泛，它通过直接操作生物体的遗传物质来生产药物或改进药物制造过程。具体来说，可以分为以下几个方面：
1. 生产重组蛋白药物 基因工程技术能够将人类或其他生物的特定基因插入到细菌、酵母菌、动植物细胞中，在这些宿主细胞内表达出所需的蛋白质。例如，利用大肠杆菌生产胰岛素就是典型的例子。
2. 制备单克隆抗体 通过将编码抗体的基因转入适当的细胞系（如小鼠骨髓瘤细胞），可以大量繁殖并分泌特定类型的抗体，用于治疗各种疾病，包括癌症和自身免疫性疾病等。
3. 基因治疗 将正常或修饰过的基因导入患者体内以替代缺陷基因的功能，达到治病的目的。例如，针对遗传性失明、血友病等罕见病的基因疗法已经取得了一定成效。
4. 开发疫苗 采用DNA重组技术构建含有特定抗原基因的载体，注射到人体后可诱导免疫反应，从而预防疾病的发生。如新冠mRNA疫苗就是利用了这一原理。
5. 生物仿制药的研发 利用基因工程技术生产与已上市药品结构相似但成本更低的新药，满足市场需求的同时降低患者负担。

总之，基因工程为新药开发提供了强有力的技术支持，并极大推动了现代医药行业的发展。