基因工程在生物技术药物中的应用主要体现在以下几个方面：
1. 生产重组蛋白和多肽类药物 基因工程技术可以将目的基因导入到适合的宿主细胞（如细菌、酵母菌或哺乳动物细胞等）中，通过这些细胞表达出所需的蛋白质或多肽。例如，人胰岛素就是利用大肠杆菌作为生产载体来制造的。
2. 制备抗体药物 通过构建嵌合抗体或者完全人类化的单克隆抗体，可以用于治疗多种疾病如癌症、自身免疫性疾病等。这类药物具有较高的特异性与亲和力，能够精准地识别并结合到靶点上。
3. 开发基因治疗产品 基因工程还被应用于直接改变患者体内缺陷基因的功能，比如通过病毒载体将正常基因导入患者的细胞内，以弥补原有功能的缺失或异常。这种方法对于遗传性疾病的治疗尤其重要。
4. 生产疫苗 采用DNA重组技术生产亚单位疫苗、合成肽疫苗以及核酸疫苗等新型疫苗形式，可以提高疫苗的安全性和有效性。
5. 基因编辑工具的应用 CRISPR-Cas9等基因编辑工具的出现使得科学家们能够在细胞水平上精确地修改目标基因序列，为开发新的治疗方法提供了可能。

总之，随着生物技术的发展，基因工程在药物研发中的作用越来越显著，不仅拓宽了我们对疾病机理的理解，也为新药的研发开辟了更广阔的前景。