药物作用的特异性主要由药物与靶点之间的相互作用决定。这里的靶点可以是酶、受体、离子通道等生物大分子，它们在细胞内或细胞表面发挥着特定的功能。当一个药物分子能够精确地识别并结合到其目标靶点时，它就能够触发一系列生理反应，从而产生预期的药理效应。
具体来说，药物与靶点之间的相互作用是由两者结构上的互补性决定的。这种结构上的匹配度越高，药物对特定靶点的选择性就越强，进而使得该药物具有更高的特异性。例如，某些药物分子因其独特的三维结构而能够精确地嵌入到酶活性中心的小口袋中，阻止底物与酶结合，从而抑制酶的功能；或者通过模拟天然配体的方式激活或阻断受体，调节信号传导路径。
此外，除了直接作用于靶点外，药物还可能通过改变细胞膜流动性、影响蛋白质折叠等方式间接地影响靶标的活性状态。但无论是哪种机制，最终实现药物特异性效应的基础都是其与特定生物分子之间高度专一性的相互识别和结合过程。
因此，在新药研发过程中，科学家们会利用各种技术手段来筛选和设计具有高亲和力、高选择性的小分子化合物，以期获得更安全有效的治疗方案。
