红霉素与克拉霉素都是大环内酯类抗生素，它们具有相似的作用机制，主要通过抑制细菌蛋白质的合成来发挥抗菌作用。但是，在临床应用上二者存在一些差异。

首先，从药代动力学特性来看，克拉霉素的生物利用度高于红霉素，这意味着口服吸收更好，血浆浓度更高，半衰期更长，因此每日给药次数可以减少，一般情况下一天两次即可，而红霉素则可能需要更频繁地给药。此外，克拉霉素对胃酸稳定，可以直接以原形服用；而红霉素在胃中容易被破坏，通常需要制成肠溶片或混悬液等特殊剂型来保护药物不被胃酸分解。

其次，在抗菌谱方面，虽然两者都覆盖了大多数革兰阳性菌和部分厌氧菌、支原体、衣原体及非典型分枝杆菌，但克拉霉素对某些特定病原微生物如幽门螺杆菌、军团菌等的活性更强。因此，在治疗消化系统疾病尤其是胃溃疡时，克拉霉素常作为一线用药。

再者，不良反应方面也有所不同。红霉素可能会引起较明显的胃肠道不适（如恶心、呕吐和腹泻）以及肝功能异常；而克拉霉素虽然也可能导致上述症状，但发生率相对较低。另外，由于其代谢途径不同，两者与其他药物之间的相互作用也不尽相同。

综上所述，在选择使用这两种药物时需要根据患者的具体情况及感染类型综合考虑，以达到最佳治疗效果并减少不良反应的发生。