注射剂和滴眼剂作为无菌制剂，其生产过程中都需要进行严格的灭菌处理以确保产品的安全性。但是由于它们的给药途径不同（注射剂通常是通过肌肉、静脉或皮下注射进入人体，而滴眼剂则是直接作用于眼部），因此在灭菌方法的选择上也有所差异。

对于注射剂而言，因为其需要直接进入血液循环系统或者组织中，对无菌的要求非常高。常用的灭菌方式包括湿热灭菌和过滤除菌两种。其中，湿热灭菌是将药物溶液加热至121℃左右持续一段时间（通常为30分钟），以彻底杀死所有微生物及其孢子；而过滤除菌则是利用孔径小于0.22微米的滤膜对药液进行过滤，去除细菌等较大颗粒物。对于一些热敏感性较强的药品，则更多地采用过滤除菌的方式。

滴眼剂虽然也是无菌制剂，但由于其使用部位为眼睛表面，并且在使用过程中可能受到外界污染的影响，因此其灭菌要求相对注射剂来说略低一些。滴眼剂主要采取的灭菌方法有湿热灭菌、辐射灭菌和化学灭菌等。其中，湿热灭菌与注射剂相似；辐射灭菌是通过γ射线或电子束照射来杀灭微生物；而化学灭菌则是向药液中加入适量的防腐剂（如苯扎氯铵）以达到抑菌效果。

总之，在选择合适的灭菌方法时需要综合考虑产品的性质、安全性以及成本等因素。