光谱分析是一种非常常用的分析方法，在主管药师课程以及实际的药学工作领域中都有着广泛的应用。

从原理上来说，光谱分析是基于物质对不同波长光的吸收、发射等特性来进行分析的。不同的物质具有其特征的光谱，就如同每个人有独特的指纹一样。通过对物质光谱的测定和分析，能够获取物质的结构、组成等信息。

在药物的鉴别方面，光谱分析发挥着重要作用。每种药物都有其特定的化学结构，这决定了它会产生特定的光谱。例如，红外光谱可以用于鉴别药物分子中的官能团，通过对比待测药物的红外光谱与已知标准药物的光谱，能够快速准确地判断药物的真伪和纯度。紫外 - 可见光谱则可用于一些具有共轭体系的药物的鉴别，根据其吸收峰的位置和强度等特征来进行判断。

在药物的含量测定中，光谱分析也是常用手段。比如紫外 - 可见分光光度法，它依据朗伯 - 比尔定律，通过测量药物溶液对特定波长光的吸收程度，来计算药物的含量。这种方法具有操作简便、快速、灵敏度较高等优点，在药物生产过程中的质量控制以及药品检验机构的检验工作中都经常被使用。

在药物的杂质检查中，光谱分析同样不可或缺。一些杂质可能会有与主药不同的光谱特征，通过光谱分析可以检测出杂质的存在，并对其含量进行初步评估。

综上所述，光谱分析在主管药师涉及的药物研究、生产、检验等多个环节都有广泛应用，是一种十分常用且重要的分析方法。