制备包合物时，存在多个影响因素，以下将详细阐述。

主客分子比例是重要影响因素之一。包合过程中，主客分子需要以合适的比例存在才能形成稳定的包合物。不同的主客分子形成包合物时有着特定的最佳比例，若比例不合适，可能无法形成包合物或者包合效果不佳。例如，当客分子过多而主分子不足时，部分客分子不能被有效包合，导致包合率降低；反之，主分子过多则会造成资源浪费。

包合温度也会对包合物的制备产生显著影响。温度会影响主客分子的运动和相互作用。一般来说，适当升高温度可以增加分子的运动速度，有利于主客分子的接触和包合过程的进行。然而，温度过高可能会破坏主客分子的结构，或者使已经形成的包合物不稳定而分解。所以，需要根据主客分子的性质来选择合适的包合温度，以保证包合反应的顺利进行。

搅拌时间和强度同样不容忽视。足够的搅拌时间可以使主客分子充分接触，增加包合的机会。搅拌强度适中时，能够促进分子的扩散和混合，但如果搅拌强度过大，可能会产生剪切力，破坏已经形成的包合物结构；搅拌强度过小，则主客分子不能充分混合，包合反应难以充分进行。

此外，药物的极性和溶解度也会影响包合效果。极性药物与非极性的包合材料之间的相互作用较弱，包合难度相对较大；而溶解度高的药物在溶液中易于与包合材料接触，但过高的溶解度可能会导致药物在包合过程中难以被有效固定在包合材料的空腔内。同时，包合材料的性质，如种类、纯度、粒径等，也会对包合物的形成和质量产生影响。不同种类的包合材料具有不同的包合能力和选择性，纯度高的包合材料有利于提高包合效果，而粒径合适的包合材料可以增加与客分子的接触面积，促进包合反应。综上所述，在制备包合物时，需要综合考虑这些因素，以获得理想的包合效果。