烷化剂是一类在体内能形成缺电子活泼中间体或其他具有活泼的亲电性基团的化合物，它的主要作用机制是与生物大分子（如DNA、RNA或蛋白质）中含有丰富电子的基团（如氨基、巯基、羟基、羧基、磷酸基等）发生共价结合，使其丧失活性或使DNA分子发生断裂，从而影响细胞的分裂和增殖，最终导致细胞死亡。

从对DNA的作用来看，烷化剂可以与DNA分子中的鸟嘌呤N - 7位、腺嘌呤N - 3位、胞嘧啶N - 1位等发生烷化反应。其中，鸟嘌呤的N - 7位是最易被烷化的位点。当烷化剂与鸟嘌呤N - 7位结合后，会使DNA的结构和功能发生改变。一方面，它可能导致DNA链发生交联，包括链内交联和链间交联。链内交联会使DNA的局部结构扭曲，影响DNA的复制和转录过程；链间交联则会阻碍两条DNA链的正常分离，使得DNA无法进行复制和转录，从而抑制细胞的分裂。另一方面，烷化后的鸟嘌呤可能会发生脱嘌呤作用，即从DNA链上脱落，形成无嘌呤位点。在DNA复制时，这些无嘌呤位点可能会导致错误的碱基插入，引起基因突变。

从对细胞周期的影响来说，烷化剂对增殖细胞群和非增殖细胞群均有杀伤作用，属于细胞周期非特异性药物。它可以作用于细胞周期的各个时相，尤其是对处于G1期和S期的细胞更为敏感。在G1期，烷化剂可以阻止细胞进入S期，使细胞停滞在G1期；在S期，它会干扰DNA的合成，导致DNA复制错误或无法完成复制，最终使细胞死亡。

此外，烷化剂还可能对RNA和蛋白质产生影响。它可以与RNA分子中的碱基发生烷化反应，影响RNA的转录和翻译过程，进而影响蛋白质的合成。同时，烷化剂也能与蛋白质分子中的某些基团结合，改变蛋白质的结构和功能，影响细胞的正常代谢和生理功能。

综上所述，烷化剂通过与生物大分子的共价结合，影响DNA的结构和功能、干扰细胞周期以及影响RNA和蛋白质的合成等多种方式发挥其细胞毒性作用，从而达到治疗