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安全评价和职业病危害评价都需要通过工程分析来识别分析生产过程及作业场所存在的危险、有害因素或职业病危害因素。两种评价都将从原辅物料、中间产品及产品、工艺过程、生产设备设施、作业场所、安全卫生投入等方面进行工程分析，但工程分析的侧重点由于评价内容不同而存在差异。如对原辅物料、中间产品及产品的工程分析，安全评价关注其易燃易爆性、活性、毒性及腐蚀性，而职业病危害评价关注的是其毒性和腐蚀性。

对生产工艺和设备设施的工程分析，安全评价分析其工程技术、工艺过程中各项参数（如温度、压力、速度、流量、材质等）可能导致的设备故障，入、物、环境和管理方面的缺陷可能导致的泄漏、火灾、爆炸和各种人身伤害事故；而职业病危害评价则分析有工人操作的工艺过程或设备设施中存在的有毒有害物质的挥发、溢出或意外泄漏及噪声等危害因素对工人健康的影响。

此外，为了保护员工的健康，更准确地掌握工人接触职业病危害因素的浓度（强度），职业病危害评价还需要对卫生用室和辅助用室、工时制度等进行分析。