由于子宫内膜异位的部位不同和个体的差异，临床症状有很大差别。少数人即使病变发展到一定程度，但症状可以很轻，甚至没有症状。一般常见的症状有：
（1）进行性加重的病经：这是因为在月经前或月经期，病灶充血、水肿及出血造成。一般在月经前1～2天开始下腹和腰部疼痛，至月经第1天最重，以后逐渐减轻。疼痛可向腿部、臀部、会阴、肛门等处放射，多为继发性的，并进行性加重，常需用止痛药。
（2）不孕：大约有3/4的病人不孕。
（3）性交痛：发生率达30～40%，多发生在子宫内膜异位于子骶骨韧带或子宫直肠窝的病例。
（4）月经紊乱：表现为月经量多，经期延长或周期紊乱。
（5）病变累及肠道或膀胱时，可出现排便疼痛，或血便、排尿困难，或尿痛、尿急等。
（6）有些病人有低热。
在检查时可发现：于它粘连，活动受限；子宫直肠窝或子宫峡部可触到结节，质硬、有触痛；如果病变累及到卵巢，可触到子宫旁有粘连固定的囊性肿块，有触痛
