1.膀胱颈硬化症（膀胱颈挛缩）：由慢性炎症所致，发病年龄较轻，40～50岁出现病状。临床表现与前列腺增生相似，但前列腺不增大。
2.前列腺癌：前列腺坚硬，结节状。鉴别须行活组织或针吸细胞学检查。
3.膀胱癌：膀胱颈附近的膀胱癌临床也表现为膀胱出口梗阻，常有血尿，膀胱镜检查容易鉴别。
4.神经源性膀胱功能障碍：临床所见与前列腺增生症状相似，有排尿困难和尿潴留，也可继发泌尿系感染、结石、肾积水和肾功能不全。但神经源性膀胱功能障碍常有明显的神经系统损害的病史和体征，往往同时伴有肛门括约肌松弛和反射消失。应用尿流动力学检查可以鉴别。
5.尿道狭窄：多有尿道损伤、感染等病史。
