主要依靠临床特征性症状，结合实验室检查，参考流行病学史进行诊断。
临床特征包括早期3种主要表现和病程的5期经过。前者为发热中毒症状，充血、出血、外渗征和肾损害。后者为发热期、低血压休克期、少尿期、多尿期和恢复期。不典型者可以越期或前三期之间重叠。病人热退后症状反而加重，有助于诊断。
实验室检查包括血液浓缩，异型淋巴细胞出现，血小板减少和尿蛋白大量出现等均有助于诊断。血清、血细胞和尿沉渣细胞中检出EHF病毒抗原和血清中检出特异性抗体IgM抗体和IgG抗体可以确诊。
流行病学史；居住或近期到过本病疫区，居住地有鼠。
