甲型肝炎复发的原因是：
（1）在康复期休息不好，活动过多，睡眠不足及过度疲劳，是复发的主要原因。1988年上海甲型肝炎大流行时，住入某医院的2608例患者中，有38例（1.45％）因复发而第二次住院。经详细调查，其中87.5％的患者是因在康复期休息不好而复发的。
（2）饮酒、精神受刺激、感冒及肠炎等因素，都将增加刚刚修复的肝脏的负荷，导致肝炎复发。
（3）不适宜的滥吃滋补品或服用过多种类的药物。
（4）一部分人感染甲肝病毒后，粪便中不存在有功能的甲肝病毒的中和性抗体。
（5）有人研究检测甲型肝炎患者病后不同时期血清甲肝病毒抗体免疫球蛋白M和G，同时检测部分患者粪便中甲肝病毒核糖核酸。痊愈组血清甲肝病毒抗体免疫球蛋白G出现早，甲肝病毒抗体免疫球蛋白M持续时间短，粪便中甲肝病毒核糖核酸排毒期短。而观察复发组甲肝病毒抗体免疫球蛋白G出现较晚或阴性，甲肝病毒抗体免疫球蛋白M时间拉长或持续阳性，粪便排毒期延长。说明甲型肝炎复发的原因，可能为机体免疫力低下，不能产生足够的甲肝病毒抗体免疫球蛋白G，清除病毒或甲肝病毒抗体免疫球蛋白G持续时间短，可导致甲肝病毒的再感染。
