手术室应设在安静、清洁、便于和相关科室联络的位置。
以低平建筑为主的医院，应选择在侧翼，以高层建筑为主体的医院，宜选择主楼的中间层。
手术室和其它科室、部门的位置配置原则是，靠近手术科室、血库、影像诊断科、实验诊断科、病理诊断科等，便于工作联系，宜远离锅炉房、修理室、污水污物处理站等，以避免污染，减少噪声。
手术间应尽量避免阳光直接照射，以朝北为易，也可采用有色玻璃遮挡，以利于人工照明。
手术室的朝向应避开风口，以减少室内尘埃密度和空气污染。通常是集中布置，构成一个相对独立的医疗区，包括手术部分和供应部分。
