按结石所在的部位可分为三种。
（1）胆囊结石：多为胆固醇结石或以胆固醇为主的混合性结石。占全部结石的50％左右。
（2）肝外胆管结石：大多数是胆色素结石或以胆色素为主的混合性结石，约占全部结石的20％-30％，其中多数在胆总管下端。多为原发性胆管结石；另有一小部分是从胆囊排至胆总管内的胆固醇结石。
（3）肝内胆管结石：是原发性胆管结石，较多见，占全部结石的20％-30％，多为胆色素结石或以胆色素为主的混合性结石。左肝管多于右肝管。
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