本病的临床表现多样化，轻重不一，发病可以缓渐或突然。多数病人病程反复发作，发作间期症状可缓解；少数病人首次发作后病情长期缓解，可持续10余年之久，这类病人一般都属轻型；也有少数病人症状持续，病情活动而不缓解。
主要症状是腹泻伴粘液脓血便，这是由于肠粘膜充血、水肿、出血和溃疡所造成，腹泻的次数取决于病变的轻重和广泛程度。腹泻严重时甚至可出现失水和电解质紊乱。病变局限于直肠时，鲜血附于粪便的表面；如炎症侵犯广泛的大肠粘膜，血常混于粪便之中。70%以上的患者有腹痛，多为痉挛性疼痛，病变常在左侧腹和下腹部，直肠的病变可致里急后重。其它症状可有腹胀、乏力、消瘦、发热等。肠外症状以关节痛居多，有时也可出现虹膜炎、阿弗它口炎、皮下结节或结节性红斑，后者多出现在小腿和上臂的外侧。
