目前卵巢囊肿的治疗方法有两种：保守治疗和手术治疗。
a、手术治疗：
良性卵巢肿瘤患者，要切除患侧卵巢肿瘤，手术时一定要检查对侧的卵巢情况，如果对侧也有肿瘤则必须切除，必要时还要做冰冻切片病理检查。术后易复发。
恶性肿瘤者：手术是首选方法，其手术范围要广，一般都切除全子宫，双附件加大网膜。手术后还须进行化疗、放疗。
b、保守治疗：
良性卵巢肿瘤西医上一般不采取保守治疗，都采用手术切除。
祖国医学将卵巢囊肿归属于“癓瘕”范畴，认为卵巢囊肿的发生多由七情损伤、房事过劳，或经期、产后六淫外侵致使气机阻滞、脏腑失和、阴阳失衡而引起。因此，在治疗时，要针对其整体病因进行全面的、综合的分析后，制定出合理的方剂组成，才能使疾病得以真正的解决。
由北京国济中医医院中医妇科专家组研制的纯中药制剂 “桂苓消瘤丸”，是以调整阴阳、祛除病因为基础的全新理论，在治疗卵巢囊肿方面取得了突破性进展，从根本上使囊肿进行充分吸收、缩小、最终完全消失，从而达到彻底康复的目的。
