肾阴与肾阳，分别代表着肾的生理活动中的寒与热、静与动、降与升、入与出等对立的状态，两者相互制约、相互协调，方能维持肾的正常生理功能，进行正常的生理活动。肾的阴阳失调，主要表现为肾阴亏虚、肾阳虚损及命门相火妄动等方面。分述如下：
肾阴亏虚
肾阴亏虚，多由久病耗伤肾阴，或因情志内伤，五志过极化火，或邪热久留化火，不仅可伤及各脏之阴，且日久必耗肾阴而致肾阴亏虚。亦可由于失血耗液，或过服温燥壮阳之品，或房劳过度而伤肾精肾阴，从而导致肾阴亏虚。肾阴亏虚，则肾阳失制，而命门相火亢盛，从而导致阴虚内热或阴虚火旺之病理表现。可见形体消瘦、腰膝痠软、五心烦热，或骨蒸潮热、颧红升火、盗汗，以及舌红少苔、脉虚细而数等症。
肾阳虚损
肾阳虚损，实即命门火衰。但在临床辨证中两者则有轻重程度之别。肾阳虚损，多由心脾阳虚及肾，或由房劳过度，肾阳损耗所致。其病理表现是阳虚则无以养神柔筋；阳虚则阴寒内生，因而可见各脏腑组织器官机能衰弱征象并有明显的虚寒之象。
命门相火妄动
肾阴虚，命火妄动，则精关被扰而失固，阴虚阳亢则性机能亢奋，故可见性欲亢进，以及遗精、早泄等病理表现。阴虚则内热自生，故可见五心烦热。阴虚不能敛阳，心神难以入舍，故见少寐多梦等病。
