根据灌肠的目的不同，灌肠后须作不同的护理。若用于治疗便秘，灌肠后患者产生便意，应鼓励并帮助病人排便。若用于治疗慢性肠炎、慢性溃疡性结肠炎及慢性肾功能衰竭应采取保留灌肠，灌肠后宜保持原来的体位并垫高臀部或更换卧位，必要时用无菌纱布卷紧堵住肛门，尽量使药物在肠道保留时间长一些，以使药物充分得到吸收，充分发挥药物的作用。当病人有便意且较强时或疲劳时即让其排便或下床活动。若用于肠镜检查或胆道造影检查应采取清洁灌肠。灌肠后应观察或了解排便的次数，最后一次排便是否仍有大便排出，若有则说明肠内食物残渣未排净，则应再行灌肠；若无说明肠道内已清洁，可行检查。
对于有肛周疾患（如痔疮）及直肠疾病（如息肉）等患者，灌肠时易引起疼痛及出血，要及时止血、抗炎等处理。
