感染性心内膜炎是指由细菌、真菌和其他微生物（如病毒、立克次体、衣原体、螺旋体等）直接感染而产生心瓣膜或心室壁内膜的炎症。其主要致病菌在不同的时期和人群中有所差异。

在自体瓣膜心内膜炎中，草绿色链球菌是最为常见的致病菌，约占一半左右。草绿色链球菌是口腔和上呼吸道的常居菌，在进行拔牙、扁桃体摘除等口腔手术或上呼吸道手术操作时，细菌可从感染灶侵入血流。由于其毒力相对较弱，常侵犯有病变的瓣膜，如风湿性心瓣膜病或先天性心脏病患者的瓣膜，在瓣膜表面形成赘生物，引发感染性心内膜炎。

金黄色葡萄球菌也是重要的致病菌之一，尤其是在医院获得性感染性心内膜炎中较为常见。金黄色葡萄球菌的致病力强，可产生多种毒素和酶，能引起急性感染性心内膜炎。它可通过皮肤、呼吸道等部位的感染灶进入血液循环，侵袭正常或已有病变的瓣膜。

肠球菌引起的感染性心内膜炎近年来有逐渐增多的趋势。肠球菌通常存在于肠道和泌尿生殖道，在泌尿生殖道手术、肠道手术或有肠道感染时，细菌可入血导致感染。肠球菌对多种抗生素耐药，治疗相对困难。

在人工瓣膜心内膜炎中，早期（术后60天内）致病菌主要为表皮葡萄球菌等凝固酶阴性葡萄球菌，这类细菌常存在于皮肤表面，在手术过程中可能污染人工瓣膜。晚期（术后60天以后）的致病菌与自体瓣膜心内膜炎相似，以草绿色链球菌、金黄色葡萄球菌等为主。

此外，真菌、革兰阴性杆菌等也可引起感染性心内膜炎，但相对较少见。真菌性心内膜炎常见于长期使用抗生素、免疫抑制剂、静脉药瘾者等免疫力低下的人群。革兰阴性杆菌如大肠杆菌、铜绿假单胞菌等引起的感染性心内膜炎病情往往较重，预后较差。

综上所述，感染性心内膜炎的主要致病菌因不同情况而异，了解这些致病菌对于诊断、治疗和预防感染性心内膜炎具有重要意义。