蛋白质能量缺乏在临床上有多种表现，可分为成人和儿童，并且会因缺乏程度不同而有所差异。

对于儿童而言，在能量和蛋白质轻度缺乏时，可能最先出现体重不增的情况。随着缺乏情况加重，会出现体重逐渐下降。患儿的皮下脂肪会逐渐减少甚至消失，一般先从腹部开始，然后是躯干、臀部、四肢，最后是面部。这使得孩子看起来消瘦，皮肤干燥、松弛、失去弹性。在精神状态方面，孩子会表现出精神萎靡、反应差、不爱活动、烦躁不安等。生长发育也会受到明显影响，身高增长缓慢甚至停滞，智力发育可能也会落后于同龄人。此外，孩子的免疫力会降低，容易反复发生呼吸道感染、腹泻等疾病。

成人蛋白质能量缺乏时，早期可能表现为体重减轻、疲倦乏力、活动耐力下降，工作和劳动能力受到影响。肌肉逐渐萎缩，尤其是四肢肌肉更为明显，导致肢体力量减弱。皮肤变得干燥、粗糙，头发干枯、易折断、失去光泽。还可能出现水肿，这是因为血浆蛋白减少，胶体渗透压降低，水分渗出到组织间隙所致，水肿通常先从下肢开始，严重时可蔓延至全身。患者的消化功能也会受到影响，出现食欲不振、消化不良、腹胀、腹泻等症状，进一步加重营养缺乏。长期的蛋白质能量缺乏还会影响心脏、肝脏、肾脏等重要脏器的功能，导致心功能不全、肝功能损害、肾功能异常等严重后果。