造血干细胞起源于胚胎期的卵黄囊血岛。在胚胎发育的早期，大约在受精后的第2周左右，卵黄囊壁上的中胚层细胞开始分化形成血岛。血岛是胚胎最早的造血场所，其周边的细胞分化为血管内皮细胞，中央的细胞则分化为原始的造血干细胞。

随着胚胎的进一步发育，造血干细胞会发生迁移。在胚胎发育至第6周左右，造血干细胞开始从卵黄囊迁移至肝脏，此时肝脏逐渐成为主要的造血器官，承担起造血的重要功能，肝脏中的造血干细胞可以分化产生各种血细胞，以满足胚胎生长发育的需求。

到了胚胎发育的第4 - 5个月，造血干细胞又会从肝脏迁移至骨髓。从胎儿后期一直到出生后，骨髓就成为了造血干细胞的主要定居和造血场所。骨髓中的造血干细胞具有高度的自我更新能力和多向分化潜能，它可以不断地自我复制，以维持自身数量的稳定，同时还能分化为不同类型的血细胞，包括红细胞、白细胞和血小板等，从而保证人体正常的血液生成和生理功能。而且，骨髓中的造血微环境为造血干细胞的生存、增殖和分化提供了适宜的条件，二者相互作用，共同维持着人体造血系统的平衡和稳定。此外，除了骨髓，外周血和脐带血中也存在一定数量的造血干细胞，它们在临床上也具有重要的应用价值，可用于造血干细胞移植等治疗手段。