小儿佝偻病主要是由于维生素D缺乏导致钙、磷代谢紊乱，使得正在生长的骨骼不能正常钙化，从而引起骨骼病变的一种营养性疾病。其病因是多方面的。

首先是围生期维生素D不足。母亲在妊娠期，尤其是妊娠后期维生素D营养不足，如母亲严重营养不良、肝肾疾病、慢性腹泻等，以及早产、双胎等，可使婴儿体内维生素D储存不足，出生后更容易发生佝偻病。

日照不足也是重要原因。皮肤内7 - 脱氢胆固醇需经波长为296 - 310nm的紫外线照射才能转化为维生素D3，因紫外线不能透过玻璃窗，婴幼儿如果缺乏户外活动，尤其是在冬季，紫外线照射量明显减少，就会影响内源性维生素D的生成。此外，大城市中高大建筑可阻挡日光照射，大气污染如烟雾、尘埃等也可吸收部分紫外线，这些都可能导致日照不足，进而影响维生素D的合成。

生长速度快也会增加患病风险。婴儿生长速度快，对维生素D和钙的需要量也相对较多。早产及双胎婴儿生后生长发育快，维生素D和钙的储备量相对不足，若未及时补充，极易发生佝偻病。

食物中维生素D摄入不足也是一个因素。天然食物中含维生素D较少，不能满足婴幼儿对维生素D的需求。人乳及牛乳中维生素D含量均低，谷物、蔬菜、水果中则更少，若不及时添加富含维生素D的食物，也容易导致维生素D缺乏。

疾病及药物影响也不可忽视。胃肠道或肝胆疾病会影响维生素D及钙、磷的吸收和利用。如婴儿肝炎综合征、先天性胆道狭窄或闭锁、脂肪泻等。某些药物也会影响维生素D的代谢，如长期服用抗惊厥药物可使维生素D加速分解，糖皮质激素会对抗维生素D转运钙的作用，从而影响钙的吸收和利用，增加佝偻病的发生几率。