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病毒侵入上呼吸道的上皮细胞内复制，然后进入血流，到达白细胞内复制后大量进入血流形成病毒血症，病毒散布于全身各器官组织，引起全身病变，皮肤病变主要为棘状细胞层的细胞水肿变性，胞核分裂成多核巨细胞，核内有嗜酸性包涵体形成，随后细胞液化，单房性薄壁水疱形成，早期疱疹液标本于电镜下观察可见内含大量病毒，由于炎症细胞增多及混入脱落的组织细胞残屑，疱疹液可逐渐变得混浊，亦可呈脓疱样外观，疱疹周围及其下部真皮组织充血，形成环绕疱疹基底部的线状红晕，晚期疱疹液中的病毒含量减少，由于病变表浅，愈合后一般不遗留瘢痕，眼，鼻，口，咽等部位的黏膜亦可有疱疹形成，且易破溃形成溃疡，但易于愈合，与此同时，水痘患者的多种组织中可发生变态反应性炎症，包括肺，肝，脾，肾上腺，胃肠道，心肌，胰腺，血管内皮及大脑组织等，水痘性肺炎患者的肺部组织呈广泛的间质性炎症，有散在灶性坏死炎变区;肺泡可出血，肺泡与细支气管内含纤维蛋白性渗出物，红细胞及有包涵体的多核巨细胞，肺间质与细支气管周围有单核细胞浸润，在水痘性脑炎患者，可见脑组织有变性坏死，点状出血，间质血管周围脱髓鞘性改变及脑血管周围淋巴细胞浸润现象。

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