口腔真菌感染中最常见的类型是由念珠菌（主要是白色念珠菌）引起的。这种感染在临床上被称为念珠菌病，它可以影响口腔的不同部位，如舌、颊内侧、咽部等，表现为红斑或白色的伪膜。念珠菌病的发生与多种因素有关，包括免疫系统的状态、长期使用抗生素或者皮质类固醇、糖尿病、以及佩戴假牙等。在临床治疗上，通常会根据病情的轻重采用局部抗真菌药物或者是口服抗真菌药进行治疗。
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