核苷酸代谢是一个复杂的过程，受到多种因素的调控。主要包括以下几个方面：
1. 酶活性的调节：酶是催化核苷酸代谢反应的关键物质，其活性可以通过底物浓度、产物反馈抑制、共价修饰等方式进行调节。
2. 基因表达水平的控制：通过转录因子与特定DNA序列结合来调控相关基因的转录活动，从而影响蛋白质特别是关键酶的数量和质量，间接地改变核苷酸代谢途径的速度和方向。
3. 细胞信号传导通路的影响：如PI3K/AKT、MAPK等信号通路能够响应外界刺激（例如生长因子、激素等），通过磷酸化修饰等方式调节与核苷酸合成或分解有关的酶活性，实现对整个代谢网络状态的动态调整。
4. 能量供应状况：细胞内的ATP/ADP比值可以作为能量感受器，当能量充足时倾向于抑制从头合成途径而促进补救合成；反之，则可能激活从头合成以满足快速增殖细胞的需求。
5. 微环境因素的作用：包括pH值、温度、氧化还原状态等物理化学条件的变化也会影响核苷酸代谢过程。例如，在缺氧条件下，某些肿瘤组织会增强嘌呤和嘧啶的补救合成途径来适应不利生存环境。

综上所述，核苷酸代谢受到多层面、多维度因素的影响，并且这些调控机制之间存在着复杂的相互作用关系。