预防口腔浅部组织细菌感染，主要可以从以下几个方面着手：
1. 保持良好的口腔卫生习惯。每日至少刷牙两次，并且每次刷牙时间不少于两分钟。采用正确的刷牙方法，确保牙齿表面和牙龈边缘清洁。使用含氟牙膏可以增加防龋效果。
2. 使用牙线或间隙刷清理牙齿间的食物残渣及菌斑，减少细菌滋生的机会。
3. 定期到口腔科进行检查与洁治，及时发现并处理如龋齿、牙周病等可能导致感染的问题。
4. 注意饮食健康，多吃富含维生素C和B族维生素的食物，增强机体免疫力；少吃甜食以及过于坚硬的食物，避免造成牙齿损伤或刺激性炎症。
5. 避免用口呼吸，因为长期张嘴呼吸会使得口腔干燥，降低唾液的抗菌作用。若因疾病原因需要通过嘴巴呼吸，则应咨询医生寻求解决办法。
6. 戒烟限酒，烟草和酒精都是引起口腔黏膜损伤的重要因素之一，增加感染风险。
7. 对于有义齿佩戴者来说，每天认真清洁假牙，并且每晚取下浸泡在清水中或专用的清洗液中过夜。
8. 在进行任何可能造成口腔创伤的操作（如拔牙、种植等）前后，严格遵守医生指导，做好术前术后护理工作，必要时服用抗生素预防感染。

通过上述措施，可以有效降低口腔浅部组织细菌感染的风险。如果出现口腔不适或疑似感染症状，应及时就医诊治。