咽囊是胚胎发育过程中形成的暂时性结构，它们在头颈部器官和系统的形成中起着重要作用。咽囊共有五对，每一对都参与了不同重要结构的形成：
第一对咽囊衍化成咽鼓管（也称为欧氏管）的上皮部分以及鼓室。
第二对咽囊衍化为腭扁桃体的被膜和实质中的淋巴组织。
第三对咽囊的一部分在发育过程中退化，其残留部分可能参与了胸腺上皮细胞的发生；另一部分则发展成为下一对结构——甲状旁腺的上部。
第四对咽囊最终形成了甲状旁腺的下部。有时候，根据不同的解剖学分类方法，这部分也可以被认为是第五对咽囊的一部分。
第五对咽囊在人类中通常不明显或完全退化，但在某些情况下，它们可能参与了甲状腺C细胞（也称为滤泡旁细胞）的发生。
这些结构对于维持人体正常的生理功能至关重要。例如，咽鼓管有助于平衡耳内外的压力；腭扁桃体是免疫系统的一部分，在抵抗感染方面发挥作用；而甲状旁腺则负责调节体内钙磷代谢等重要功能。
