肠球菌和奈瑟菌是两种不同的细菌，它们在临床诊断中具有重要的意义。为了正确地鉴别这两种细菌，了解它们之间的生化差异是非常必要的。
1. 形态学特征：肠球菌为革兰氏阳性球菌，通常成对或短链状排列；而奈瑟菌则为革兰氏阴性双球菌，常见于成对排列。这一特性在初步鉴别时具有一定的参考价值。
2. 生化反应：
   - 肠球菌：肠球菌可以水解胆汁七叶苷（Bile Esculin Test），这是其一个典型的生化特征；同时，它们能够耐受6.5%的NaCl环境。此外，肠球菌对甲氧西林敏感性试验呈阴性。
   - 奈瑟菌：奈瑟菌不能水解胆汁七叶苷，但可以氧化酶阳性（Oxidase Test），这是鉴别奈瑟菌的一个重要标志；另外，大多数奈瑟菌能利用葡萄糖和麦芽糖产生酸而不产气。
3. 抗生素敏感性：肠球菌对抗生素如青霉素、氨苄西林等表现出不同的敏感度。而奈瑟菌对多种抗生素敏感，例如青霉素G、头孢曲松等。
4. 培养条件：在血平板上培养时，肠球菌可形成圆形、光滑、边缘整齐的小菌落；奈瑟菌则需要更加丰富的营养基质（如巧克力琼脂），并且在35-37℃条件下生长良好。

通过上述生化试验及形态学观察等方法可以有效地区分这两种细菌。但在实际工作中，为了确保结果的准确性，往往还需要结合其他检测手段进行综合判断。