多肽链的二级结构是指蛋白质中由氢键稳定的一段连续氨基酸残基的局部空间构象,不涉及侧链的具体位置。主要的二级结构类型包括:
1. α-螺旋(Alpha Helix):α-螺旋是一种常见的二级结构形式,其中每个氨基酸残基沿着螺旋轴旋转约100度,并向上移动0.15纳米。这种结构是由肽键中的羰基氧与第四个氨基氮之间的氢键所稳定。
2. β-折叠或β-片层(Beta Sheet or Beta Pleated Sheet):在β-折叠中,多肽链可以是平行的或是反平行的排列方式。相邻的氨基酸残基之间通过氢键相互作用而形成平面状结构。每个肽单元都位于同一平面上,并且两个链之间的距离约为0.34纳米。
3. β转角(Beta Turn):β转角也称为回折或发夹结构,它是一种短小的二级结构元素,通常由四个氨基酸残基组成。这种结构允许多肽链发生180度的方向改变,并且在蛋白质折叠过程中起到连接不同二级结构区域的作用。
4. 无规则卷曲(Random Coil):除了上述明确定义的二级结构外,在某些情况下,多肽链可能没有明显的规律性排列,这类结构被称为无规则卷曲。虽然称为“无规则”,但这些部分也可能具有特定的功能或参与蛋白质的整体折叠过程。
以上就是多肽链中常见的几种二级结构类型。