革兰染色是一种常用的细菌鉴别方法，其主要依据是细菌细胞壁结构的不同。具体来说：
1. 革兰阳性菌和革兰阴性菌的主要区别在于它们的细胞壁组成不同。革兰阳性菌的细胞壁较厚，含有较多的肽聚糖层，并且含有大量的磷壁酸；而革兰阴性菌的细胞壁相对薄一些，肽聚糖含量较少，但外膜中含有脂多糖和蛋白质。
2. 在进行革兰染色时，首先使用结晶紫对所有细菌进行初染，然后用碘液处理使染料与细菌结合得更紧密。接下来，用酒精脱色，这时革兰阳性菌由于其细胞壁较厚、肽聚糖层较多，能够抵抗酒精的脱色作用，保持紫色；而革兰阴性菌则因为细胞壁薄且含有外膜结构，在酒精的作用下容易失去初染的颜色变为无色。
3. 最后一步是复染步骤，通常使用番红等红色染料。这样，经过整个过程之后，革兰阳性菌呈现蓝紫色，而革兰阴性菌则被染成红色或粉红色。
通过观察细菌在显微镜下的颜色变化，可以初步判断其属于哪一类，这对临床诊断和治疗具有重要意义。
