分枝杆菌染色特性主要体现在其独特的抗酸染色结果上，这与该菌的细胞壁结构密切相关。

分枝杆菌细胞壁含有大量脂质，如分枝菌酸，含量可占细胞壁干重的60%左右。这种丰富的脂质成分使得一般的染色方法难以使细菌着色。在进行常规的革兰染色时，分枝杆菌不易被染上颜色，结果观察不清晰，所以通常不采用革兰染色来对其进行鉴别。

而抗酸染色是用于分枝杆菌染色的经典方法。其具体操作过程包括：先将标本涂片固定，然后用石炭酸复红加温染色，由于石炭酸复红能溶解分枝杆菌细胞壁中的脂质，从而使染料进入菌体内，让细菌被染成红色。接着用3%盐酸酒精脱色，因为分枝杆菌细胞壁的脂质含量高，能抵抗盐酸酒精的脱色作用，所以细菌仍然保持红色。最后用美蓝复染，其他非抗酸菌会被染成蓝色，而分枝杆菌则在蓝色背景下呈现为红色。

分枝杆菌的这种抗酸染色特性具有重要的临床意义。在临床检验中，通过抗酸染色可以快速、初步地对标本中是否存在分枝杆菌进行筛查。例如，在肺结核的诊断中，对患者的痰液标本进行抗酸染色，如果在显微镜下观察到红色的抗酸杆菌，结合患者的临床症状和其他检查结果，就可以为肺结核的诊断提供重要依据。此外，这种染色特性也有助于对分枝杆菌进行分类和鉴定，在研究分枝杆菌的生物学特性和流行病学调查等方面都发挥着关键作用。