牙源性角化囊肿是一种常见的牙源性囊肿，具有独特的病理特点。从组织学结构来看，其囊壁较薄，由复层扁平上皮构成，一般厚度较一致，约 5 - 8 层细胞，没有上皮钉突。上皮表面呈波浪状或皱褶状，表层的角化主要为不全角化，呈波纹状，这是牙源性角化囊肿的重要病理特征之一。有时也可见正角化，表现为均匀嗜伊红染色的角化物。
囊壁上皮的基底层细胞界限清楚，呈柱状或立方状，核呈栅栏状排列，染色深且远离基底膜，具有明显的极性。在纤维囊壁方面，较薄，一般无炎症，但合并感染时，囊壁可变厚，纤维组织内有大量炎症细胞浸润。纤维囊壁内有时可见微小的子囊和（或）上皮岛，这一特征使得牙源性角化囊肿在手术摘除后容易复发。
牙源性角化囊肿的内容物通常为白色或黄色的角化物或油脂样物质，这与其他牙源性囊肿的内容物有所不同。在超微结构上，囊壁上皮细胞具有活跃的代谢活动，细胞间连接较为疏松，这可能与囊肿的生长和扩张有关。此外，牙源性角化囊肿还可能与一些综合征相关，如痣样基底细胞癌综合征，此时除了囊肿本身的病理表现外，还可能伴有其他组织和器官的异常改变。总之，牙源性角化囊肿的这些病理特点对于其诊断、治疗及预后评估都具有重要意义。
