含牙囊肿又称为滤泡囊肿，它的成因主要与牙发育过程中的异常情况密切相关。在牙的发育过程中，牙冠形成后，缩余釉上皮与牙冠之间会存有少量的液体。正常情况下，这些液体处于相对稳定的状态，不会引发病变。

然而，当某些因素影响到这个平衡时，就可能导致含牙囊肿的形成。最常见的原因是缩余釉上皮与牙冠之间液体的异常增多。这可能是由于局部的炎症刺激，比如牙齿萌出过程中受到感染，炎症因子会促使组织液的渗出增加，使得缩余釉上皮与牙冠之间的液体不断积聚。随着液体量的增多，压力逐渐增大，会使周围的组织被压迫、吸收，从而形成囊肿。

另外，牙胚发育过程中的异常也可能是成因之一。在牙胚发育时，如果牙板上皮剩余发生异常增殖，就可能干扰正常的牙发育进程，进而导致含牙囊肿的出现。而且，牙发育过程中如果出现萌出障碍，比如牙冠表面的上皮与缩余釉上皮之间发生粘连，使得牙不能正常萌出，也会造成液体在局部的潴留，最终形成含牙囊肿。

含牙囊肿通常发生于牙冠形成后，包围着未萌出的牙冠，囊壁一般来源于缩余釉上皮。它好发于下颌第三磨牙及上颌尖牙等部位。在临床上，通过X线检查可以发现圆形或椭圆形的透光区，边界清晰，内含有未萌出的牙冠。了解含牙囊肿的成因，对于其诊断、治疗以及预防都具有重要的意义。