根据反应的阳性程度及阳性特点可进行红细胞系统、白细胞系统等疾病的辅助诊断及鉴别诊断，其阳性特点意义更大。
1.
白血病类型鉴别
急性粒细胞白血病原始粒细胞呈阴性或弱阳性反应，阳性以弥漫性为主；急性淋巴细胞白血病原幼淋巴细胞多呈块状阳性反应，也有少数呈阴性反应；急性单核细胞白血病原幼单
核细胞呈阳性反应，其颗粒细小，弥散分布。
2.淋巴系统增生疾病鉴别
淋巴系统恶性增生如恶性淋巴瘤、霍奇金病、慢性淋巴细胞性白血病、急性淋巴细胞性白血病时，其淋巴细胞阳性反应均有明显增高，呈粗颗粒状或块状。传单时淋巴细胞的PAS轻度增高，而其他病毒感染时常在正常范围。
3.幼红细胞增生疾病鉴别
红血病、红白血病、骨髓增生异常综合征中其幼红细胞反应明显增强，呈均匀红色或状。缺铁性贫血、地中海贫血、溶血性贫血及巨幼细胞性贫血时幼红细胞PAS反应多为阴性或仅可轻度增高。
4.确定巨核细胞
发育成熟的巨核细胞此反应多呈阳性，小巨核细胞时亦常呈阳性反应，故为确认小巨核细胞最常用手段之一。
5.细胞鉴别
鉴别巨核细胞和Reed-Sternberg细胞，巨核细胞呈强阳性，Reed-Sternberg细胞呈阴性或极弱阳性反应；鉴别高雪氏细胞和尼曼-匹克细胞，高雪氏细胞呈强阳性尼曼-匹克细胞常为阴性或极弱阳性。
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